Su privilegiada situación geográfica a caballo entre la meseta norte, el Valle del Ebro y el País Vasco, hace que Miranda de Ebro esté considerada un importante nudo de comunicaciones, especialmente ferroviario.

Por el municipio discurren numerosas carreteras nacionales, autovías y autopistas que unen a la ciudad con todas las capitales que la rodean. En proyecto están una nueva autovía y una autopista, que tendrán su punto de partida en esta ciudad. La primera es la A-68 o Autovía del Ebro que unirá Miranda con Aragón a través del valle del Ebro; la segunda es la AP-69 o Autopista Dos Mares que unirá Miranda con la cornisa cantábrica a través de las Merindades.

Ameyugo se encuentra en la Carretera Nacional-I, dirección Bugos- Irún en el Km. 308

En la actualidad lo atraviesa la carretera nacional N-I, la autopista A-1 y el ferrocarril Madrid-Irún.

Otras carreteras que atraviesan su término son la N-232 Logroño-Santander y la CL-625 Pancorbo-Bilbao.